Utvecklar ett DNA-test som kan upptäcka en förödande mangosvamp

Den colombianska mykologen Catalina Salgado-Salazar hjälper till att utveckla ett genetiskt test för att identifiera en svamp som orsakar en sjukdom som redan har drabbat Asiens mangoindustri och kan hota grödor i både USA och Colombia.

Salgado-Salazar, som är forskare vid United States Department of Agriculture’s Agricultural Research Service (USDA ARS), säger att hon för närvarande arbetar på utvecklingen av en diagnostisk analys för att upptäcka plötslig mangonedgång orsakad av svampen Ceratocystis manginecans.

“Sjukdomen rapporterades första gången 1998 i Oman och Pakistan, och hotade allvarligt deras mangoindustri och barkbaggar (Hypocryphalus mangiferae) är kända för att vara en vektor för patogenerna för plötslig nedgång i mango, säger hon och tillägger att även om denna skalbagge för närvarande finns i Florida och Puerto Rico, har mango plötslig nedgång inte rapporterats i USA, dess territorier eller i någon mango producerande land i Central- och Sydamerika.

Det finns cirka 35 000 hektar (85 000 hektar) mango odlad i Colombia och från och med 2018 i USA det fanns 2 000 tunnland under odling i Florida och cirka 4 000 tunnland i Puerto Rico.

“Hotet om att C. manginecans skulle etablera sig i USA och andra länder skulle få förödande konsekvenser för mangoodlarna såväl som betydande konsekvenser för den kommersiella handeln med denna frukt”, säger Salgado-Salazar.

Hon och hennes team börjar leta efter de genetiska markörerna och när en unik DNA-region eller gen som är specifik för denna svamppatogen har hittats, kan vilken typ av analys som helst utvecklas beroende på behov och möjligheter hos vilken byrå eller land som helst.

“När resurserna är knappa kan det vara en enkel PCR-analys där närvaro/frånvaro kan bestämmas, eller ett bärbart verktyg för patogendetektering med hjälp av LAMP-teknik (loop-medierad isotermisk amplifiering)”, säger hon och tillägger att projekt som detta är viktigt att upptäcka högrisksvamppatogener innan de når sårbara länder, vilket möjliggör en snabb reaktion i fall denna patogen av misstag introduceras till mangoproducerande områden i USA och andra länder.

Södra Colombia till världen

Salgado-Salazar växte upp i Pasto, huvudstaden i departementet Nariño (delstaten) i Colombia.

“Sedan jag var liten har jag älskat naturen, växter och djur”, säger hon, “jag hade en väldigt trevlig biologilärare i 8:an och jag älskade att göra mina biologiläxor.”

Salgado-Salazar säger att hon sedan dess visste att hon ville bli biolog, men det var inte förrän hon som doktorand och arbetade på min masterexamen som hon tog flera kurser i svampbiologi och började på vägen till att bli mykolog .

“Som en forskare från det globala södern som migrerade till det globala norr, förstår jag konsekvenserna som bristen på forskningsfinansiering kan få för utvecklingen av lösningar på frågor som för närvarande påverkar jordbruket i det globala södern”, säger hon och tillägger att en av målen för hennes karriär med USDA är att utveckla meningsfulla samarbeten med forskare i Colombia och andra delar av den globala södern.

“Forskare i den globala södern kan ha många års erfarenhet av att hantera växtskyddsfrågor under dessa förhållanden och kan tillföra en mängd kunskap till samarbeten med partners över hela världen”, säger Salgado-Salazar.

En annan colombiansk forskare som arbetar utomlands för att skydda grödor från industriförstörande svamp är Fernando Garcia-Bastidas.

MER FRÅN FORBESDenna colombian var tvungen att berätta för sitt land att de hade en ny bananpestFörbi Andrew Wight

Han har ägnat hela sin karriär åt att rädda bananer från att dö ut från Panamasjukan, men nu har hans arbete ny brådska efter att ha varit tvungen att informera myndigheterna i hemlandet om att en ny stam hade kommit.